เกาะคิวชู เป็นเกาะที่มีขนาดใหญ่ใหญ่เป็นอันดับ 3 มีพื้นที่ 42,154 ตารางกิโลเมตร อยู่ทางตะวันตกเฉียงใต้ของเกาะฮอนชู กล่าวกันว่า ชนเผ่ายามาโต ซึ่งเป็นบรรพบุรุษของชาวญี่ปุ่น ได้มาตั้งถิ่นฐานที่นี่เป็นแห่งแรก แล้วค่อย ๆ ขยายตัวเข้าไปในดินแดนตอนใน บนเกาะฮอนชูมีภูเขาไฟที่ยังคุกรุ่นอยู่เป็นจำนวนมากกว่าบนเกาะใดในญี่ปุ่น รวมถึงภูเขาไฟอาโซะ (Aso) ซึ่งมีปากปล่องภูเขาไฟใหญ่ที่สุดในโลก คือวัดโดยรอบได้ถึง 120 กิโลเมตร ทางตอนบนของเกาะคิวชูเป็นเขตเมืองอุตสาหกรรมที่มีชื่อเสียง และทางตอนใต้ก็เป็นแหล่งเกษตรกรรมที่สำคัญ

ทางตอนใต้ของเกาะคิวชู เป็นที่ตั้งของหมู่เกาะโอกินาวา ซึ่งประกอบไปด้วยเกาะน้อยใหญ่ที่อยู่กระจัดกระจายในบริเวณกว้าง นับจากตะวันออกถึงตะวันตกได้ประมาณ 1,000 เมตร มีเกาะรวมกันประมาณ 70 เกาะ มีหาดทรายขาวสวย น้ำทะเลสีครามและปะการังที่ยังสมบูรณ์ ทำให้โอกินาวาเป็นแหล่งท่องเที่ยวพักร้อนในฝันของชาวญี่ปุ่น

ภูมิอากาศในภูมิภาคนี้จะเป็นแบบเขตร้อน อากาศอบอุ่น มีปริมาณน้ำฝนมาก เมื่อถึงฤดูหนาว อากาศทางตอนใต้ก็ยังอุ่น ในขณะที่ทางตอนเหนือแถบจังหวัดฟุกุโอกะจะเย็นกว่า บนภูเขาอาจมีหิมะบ้างในบางครั้ง ในฤดูร้อนอากาศร้อนชื้น ในช่วงเดือนสิงหาคมและกันยายนของทุกปีจะมีพายุไต้ฝุ่นพัดผ่านบ่อยครั้ง